一、进行行政事业单位部门预算管理的必要性 
　　行政事业单位部门预算管理能够行使监管职能：一方面，部门预算管理与国库集中支付、政府采购等财政改革相配套，对财政资金实行全程监控，明确了资金的动向，及时的发现漏洞，维护国家公共财政资金的安全使用；另一方面，部门预算管理规范了财政收支行为，降低了资金安排的随意性；此外，通过对资金的管理分析，可以了解行政事业单位运行的整体动态，帮助相关部门做出相应的调控政策，对资金的流动和运行起导向作用。 
　　部门预算管理还能反映工作中存在的具体问题。通过对经费使用和工作进程的对比和分析，能够直接地反映单位各部门和个人工作的具体情况，从而做出客观的评价，便于相关部门和领导采取相应的绩效考核机制，制订奖惩措施，促进部门或个人提高工作效率，使行政事业单位的工作积极有序地开展。 
　　二、行政事业单位部门预算管理的现有状况 
　　国家公共财政改革以来，已建立了一套比较科学、规范的部门预算管理体系，在规范行政事业单位财务运行、整合财务资源方面起到了重要的作用。但是，目前行政事业单位预算管理依然存在着一定的问题。具体体现在以下几个方面： 
　　一方面，监督管理的体系不健全，相关职能部门没有进行有效监管，不能体现监管职能的公平性，预算管理监督不公开透明，第三方参与监督的力量相对薄弱。由于缺乏监督和约束，预算的编制与执行存在脱节现象，不能做到专款专用，项目串用、预算透支等问题依然存在。到年底了，预算不够的进行追加，而项目资金有结余的，又有突击花钱的现象。因此，预算的执行比较随意，使得行政事业单位部门预算缺乏本质上的影响力。 
　　另一方面，缺乏科学的预算管理方法，这是行政事业单位部门预算管理的薄弱环节。如预算编制不严谨、不科学，定额支出偏高或偏低。特别是在弹性比较大的项目预算上，预算单位为了本部门的利益，总是尽量地多报预算，而财政部门在审核时，没有科学的约束机制，形成“会哭的孩子有奶吃”的现象，这些都会给资金的支出带来压力，造成财政资金安排不合理、部门预算管理不科学的问题。 
　　此外，行政事业单位财会人员业务素质有待提高。行政事业单位的财务工作主要以报账、核算为主，不象企业的财务人员需要参与到生产、销售等管理活动中，因此有的行政事业单位对财务人员的配备不重视，少数行政事业单位财务人员无证上岗，或由其他人员兼职，专业知识短缺和业务能力的匮乏也使得一部分单位的财务管理混乱，部门预算不能得到很好的执行。 
　　三、加强行政事业单位部门预算管理的方法 
　　首先，健全行政事业单位部门预算管理的监督体系，财政、审计等部门在监管时应根据实际情况，在事前、事中和事后参与到预算的管理中。一、预算编制应精细化，根据实物消耗情况，进一步完善支出定额标准。对于行政事业部门的项目预算，应尽可能地量化、细化，保证各项开支的合理性。对于较大的项目预算，在条件允许的情况下，可采取公开听证的方法，邀请业内的专家学者及辖区群众参与听证，较大层面的确保资金预算科学合理。二、完善预算执行过程中的监督，通过国库集中支付系统或财务报表等，财政部门可以监控部门资金的预算执行进度，及时发现和处置问题。三、预算年度结束后进行预算执行情况检查，重点关注项目资金的使用，并继续推行预算公开，促使行政事业单位做到规范开支、专款专用。 
　　其次，从技术角度加强行政事业单位部门预算管理能力，开发相应的行政单位部门预算的专业操作管理系统，通过科学的手段进行管理，减少人为因素。象目前已推行的国库集中支付，对部门预算管理的动态化，全程化起到了重要的作用，但因为刚步入轨道，在系统运行过程中还存在数据滞后等一些技术方面的问题，因此，还要继续地开发和探索，使部门预算管理能力得到不断地提高。 
　　再次，应加强对财务人员的培训，不断提升财务人员的专业素质和职业道德。财政、审计等部门应为提高财务人员的地位多作宣传，举办多种形式的培训，并适时激励，使得财务人员以本职工作为荣，发挥主观能动性，参与到单位的业务管理中，更科学地编制部门预算，量入为出，保证单位重点工作的资金支持，在加强单位的部门预算管理中起到中坚作用。 
　　总之，行政事业单位部门预算管理，是行政事业单位内控制度的重要组成部分，也是政府各项工作有效开展的前提和保障。应通过加强行政事业单位部门预算管理，保证财政资金运行的规范性、安全性和有效性，真正实现资金使用效率的最大化和预算管理效率的最优化。